每位作者与出版平台所签的合约都不一样，不能一概而论。
原则上，个人作者创作的作品，其所有著作权天然属于作者本人。但若要发行单行本，仅凭作者个人是拿不到书号的。于是这时便要与出版社合作，同时签订合约，将发行相关的权利授予出版社，并列明授权方式与期限。当然，这其中的授权方式是各不相同。大多出版社会选择有年限地获取这部分权利，也有部分出版社会选择一次买断。出版社获得这些权利之后，就可以出版单行本了。
同时，著作权包含着很多方面权利。单行本出版归单行本出版，数字版权又是另外一块。作者可以将不同性质的版权分别授予不同的平台，只要这当中的各份合约上不存在权利冲突就没问题了。
最后，有些漫画网络连载版作者名变成了公司名，可能是这些连载的作者将网络连载委托给其他公司或机构代为管理，他们能否拿到稿费要看他们每人的合约条件是如何签订，在此不作猜测。
希望这些说明能解决你的疑惑。